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Liste des Propositions d'Opérations - février 2007
Propositions d'opérations en réponse au 1er appel à propositions du CPER MISN 2007-2013, thème MBI
CPER Modélisation, Informations et Systèmes Numériques (MISN) 2007-2013
Thème MBI : Modélisation des Biomolécules et de leurs Interactions
Propositions d'opérations : 15 février 2007
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Coordinateur
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Laboratoire
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Titre de l'opération
proposée
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Partenaires
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Budget demandé |
Durée |
| MD Devignes |
Loria-Orpailleur |
G-BioModeL 2007 Création du Centre de Compétence et de Transfert pour la Génomique et la Modélisation des Biomolécules en Lorraine |
Gros équipement (cluster, climatisation): 90 K€ Stations de travail : 12 K€ Licences logiciels modélisation : 53 K€ Fonctionnement: 5 K€ |
30 mois | |
| Pierre Leblond |
LGM INRA-UHP UMR 1128 |
Strepto-TH Modélisation de génomes bactériens du genre Streptococcus pour l'identification de séquences issues du transfert horizontal |
Instrumentation pour les validations biologiques : 58 K€ Stations de travail et serveur : 10 K€ Licences logiciels analyse de séquences : 3 K€ Fonctionnement (missions, stagiaires, consommables) : 18 K€ Etalement des dépenses prévu environ 1/3 par année |
36 mois | |
| Isabelle Debled-Rennesson | LORIA-Adagio | MAPP
Modélisation des assemblages protéine-protéine NB1 : Opération également déposée à MIS NB2 : Opération visant à préparer une seconde opération de 36 mois |
Utilisation du cluster de calcul du CCT (projet G-BioModeL 2007) Stations de travail et portables : 10 K€ CDD Ingénieur 12 mois Fonctionnement (missions, stagiaires) : 10 K€ |
24 mois |
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| Bernard Maigret | LORIA-Oprailleur | VSM-G Criblage virtuel cible-ligands : extension du prototype VSM-G en vue d'une application aux interactions ARN-protéines |
Utilisation du cluster de calcul du CCT (projet G-BioModeL 2007) Fonctionnement (missions, stagiaires) : 30 K€ par an |
36 mois |
Acronymes, Titres et participants
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1. G-BioModeL 2007 : création du Centre de Compétence et de Transfert pour la Génomique et la Modélisation des Biomolécules. Resp : MD Devignes (LORIA-Orpailleur). Partenaires : JM Engasser (INPL-ENSAIA-Laboratoire Biocatalyse Bioprocédés), S Duplessis et M Chalot (UMR 1136 INRA-UHP, Flavio Maina (IBDML, UMR6216, Marseille).
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2. Strepto-TH : Modélisation de génomes bactériens du genre Streptococcus pour l'identification de séquences issues du transfert horizontal. Resp : P Leblond (LGM UMR1128) et JF Mari (LORIA-Orpailleur)
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3. MAPP : Modélisation des assemblages protéine-protéine. Resp : I Debled-Rennesson (LORIA-Adagio) et B Maigret (LORIA-Orpailleur). Remarque cette proposition est également soumise au thème MIS.
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4. VSM-G : Criblage virtuel cible-ligands : extension du prototype VSM-G en vue d'une application aux interactions ARN-protéines. Resp : B Maigret (LORIA-Orpailleur) et F Leclerc (MAEM). Partenaire : E Jeannot (LORIA-Algorille)
Pattern Recognition for Bioinformatics, Nice, June 17-19, 2013 & Computational Intelligence Methods for Bioinformatics and Biostatistics, Nice, June 20-22, 2013