1) GBMDATA (Serveur + Baie de stockage)

Il est constitué de :
➢ 2 partitions de 2,7 To chacune (gbmdata1 et gbmdata2)
➢ 2 cpu avec 2 cœurs chacun
➢ 4 GB de mémoire principale

Système d'exploitation :
- Red Hat Enterprise Linux Server release 5.3 (Tikanga)

2) GBMDATA3 (Serveur de stockage)

Il est constitué de :
➢ 1 partition de 3,7 To (gbmdata3)
➢ 1 cpu
➢ 2 GB de mémoire principale

Système d'exploitation :
- Red Hat Enterprise Linux Server release 6.0 Beta (Santiago)

3) GBMSTORAGE (Serveur + Baie de stockage)

Il est constitué de :
➢ 2 partitions de 11 To chacune (gbmdata4 et gbmdata5)
➢ 16 cpu avec 4 cœurs chacun
➢ 12 GB de mémoire principale

Système d'exploitation :
➢ Red Hat Enterprise Linux Server release 5.3 (Tikanga)


4) CLUSTERMBI (Serveur de calcul)

Il est constitué de :
➢ 2 baies disques de 5To chacune
➢ 1 machine frontale qui sert de connexion au cluster et de réservation
➢ 30 nœuds de calcul contenant 8 cœurs chacun soit un total de 240 cœurs
➢ 8 des 30 nœuds sont connectés chacun à un Tesla de 2GPUs C1060 (soit 8 Telsas et 16 GPUs en tout). Chaque GPUs contient 240 cores + 4Gb RAM.

Chacun des 30 nœuds contient :
➢ 2 cpu avec 4 cœurs chacun
➢ 16 GB de mémoire principale
➢ Connexion réseau à 1 GB
➢ 215 GB d'espace disque temporaire disponible sur /tmp

Système d'exploitation :
➢ CentOS 5.2 avec presque tous les packages installés.

Interface web de monitoring : http://clustermbi

5) GBMCLUSTER (Serveur de calcul)

Il est constitué de :
➢ 1 master qui sert de connexion au cluster et de réservation
➢ 16 nœuds de calcul contenant 8 cœurs chacun soit un total de 128 cœurs

Chaque nœud contient :
➢ Un disque dur de 42 Go
➢ 2 cpu avec 4 cœurs chacun
➢ chaque cpu tourne à 1861.917 MHz
➢ 8 GB de mémoire principale
➢ Connexion réseau à 1 GB

Système d'exploitation :
➢ Scientific Linux SL 5.0  avec presque tous les packages installés

Il est relié à 5 partitions destinées au stockage de données :
➢ gbmdata1 : 2,7 To
➢ gbmdata2 : 2,7 To
➢ gbmdata3 : 3,7 To
➢ gbmdata4 : 11 To
➢ gbmdata5 : 11 To

Logiciels disponibles :
➢ OAR (v2.4.3)
➢ OAR Monika, OAR DrawGantt, OAR Ganglia
➢ Apache
➢ MySQL (v 5.0.77)
➢ Suite Schrodinger - release 2010 (dans le répertoire : /cvos/shared/apps/schrodinger/)

Interface web de monitoring : http://gbmcluster


6) GBMSERV (Serveur d'applications)

Il est constitué de :
➢ Un disque dur de 660 Go
➢ 4 cpu avec 2 cœurs chacun
➢ 16 GB de mémoire principale

Système d'exploitation :
- Ubuntu 8.04.4 LTS (Hardy)

Il est relié à 5 partitions destinées au stockage de données :
➢ gbmdata1 : 2,7 To
➢ gbmdata2 : 2,7 To
➢ gbmdata3 : 3,7 To
➢ gbmdata4 : 11 To
➢ gbmdata5 : 11 To

Logiciels disponibles :
➢ Cambridge Structural Database - release 2011
➢ KoriBlast (v3.1)                                                                 (taper setenv JAVA_HOME /usr/lib/jvm/java-6-sun; setenv PATH $JAVA_HOME/bin:$PATH; KoriBlast)
➢ Mulgara (v2.1.9)                                                               (accès via l'adresse : http://gbmserv:8088)
➢ Apache
➢ MySQL (v14.12)
➢ PostGreSQL (v8.3 et v8.2.9)
➢ phpMyAdmin                                                                     (accès via l'adresse : http://gbmserv/phpMyAdmin)
➢ Tomcat
➢ MpiBlast

Interface web recensant les applications web (accessibles seulement depuis le LORIA) : http://gbmserv
Interface web recensant les applications web (accessibles depuis l’extérieur) : http://plateforme-mbi.loria.fr

7) GBMSERV2 (Serveur d'applications)

Il est constitué de :
➢ Un disque dur de 2 To
➢ 24 cpu avec 6 cœurs chacun
➢ 65 GB de mémoire principale

Système d'exploitation :
- Red Hat Enterprise Linux Server release 6.2 (Santiago)

Il est relié à 5 partitions destinées au stockage de données :
➢ gbmdata1 : 2,7 To
➢ gbmdata2 : 2,7 To
➢ gbmdata3 : 3,7 To
➢ gbmdata4 : 11 To
➢ gbmdata5 : 11 To

Logiciels disponibles :
➢ Apache
➢ MySQL (v14.12)
➢ phpMyAdmin                                                                        (accès via l'adresse : http://gbmserv2/phpMyAdmin)
➢ KNIME                                                                                  (taper knime)
➢ Coron                                                                                  (dans le répertoire /opt/coron-0.8/)
➢ Web service Coron

8) MBISERVER

Permet de faire du calcul sur carte graphique.

9) GBMWS (station graphique haute performance )


10) CRICK (Serveur ZOPE)
   
Il s'agit du serveur qui héberge le présent site http://bioinfo.loria.fr.

Il est constitué de :
➢ 3 partitions de plus de 100 Go
➢ 4 cpu avec 1 cœur chacun
➢ 2 GB de mémoire principale